Мне удалось сделать то, что я хочу, не со строкой в таблице, а со столбцом в таблице.
Это выглядит так: на моем myHiloTable один столбец на объект, который я хочу использовать hilo для генерации идентификаторов. так что это будет таблица с одной строкой и множеством столбцов.
myHiloTable:
entity1 | entity2 | entity3
и пример конфигурации для entity2:
<id name="whateverYourIdNameIs" type="java.lang.Integer">
<column name="whateverYourColumnNameIs" />
<generator class="hilo">
<param name="table">myHiloTable</param> //tablename is same for all entities
<param name="column">entity2</param> //column name changes for entity
</generator>
</id>