Вместо вызова AlertDialog, просто сделайте что-нибудь на Java со значением параметра "html", если я не совсем понимаю, о чем вы спрашиваете.
String savedHtml = null;
/* An instance of this class will be registered as a JavaScript interface */
class MyJavaScriptInterface
{
@SuppressWarnings("unused")
public void showHTML(String html)
{
savedHtml = html; // this ought to work.
}
}