Параметры в пользовательской области влияют только на текущего пользователя и относительно безопасны для установки. Они хранятся в определенном для пользователя месте, поэтому нет реальной проблемы с записью в них.
Настройки области приложения, с другой стороны, доступны только для чтения и не могут быть изменены