Я проверил это на своей копии Aptana Studio 3 для OS X, и я получил точно такие же результаты.Я также протестировал несколько других тем.Все они правильно раскрасили синтаксис: , за исключением тема 'Aptana 2.x'.Так что, похоже, это ошибка данной конкретной темы.
Вы можете скопировать тему Aptana 2 по умолчанию и импортировать ее в Aptana 3, но нет гарантии, что она будет работать точно так же.
Я могу порекомендовать вам использовать включенную тему 'Eclipse', поскольку она предлагает правильную подсветку синтаксиса.Это также похоже на то, к чему вы привыкли.