Ваша база данных заблокирована, потому что у вас где-то запущена транзакция.
Остановите все ваши приложения Django. При необходимости перезагрузите компьютер.
Также удаленно возможно, что вы потерпели крах клиента SQLite в середине транзакции и блокировка файла осталась на месте.