Расширение того, что сказал Flukey; вам нужно написать скрипт, который сделает это за вас; прямого экспорта -> импорта нет, поскольку MySQL - это реляционная база данных, а MongoDB - это база данных NoSQL.
Для дальнейшего понимания NoSQL вы можете прочитать здесь: NoSQL
Вы можете сделать что-то вроде экспорта в CSV и импорта в mongo, как описано в этой статье Импорт CSV однако, очень вероятно, что ваша схема в NoSQL будет отличаться от MySQL; так что действительно стоит спроектировать вашу схему, чтобы она соответствовала данным, а затем перенастроилась.