Да, приложение Juce может быть написано для Android с использованием OS X (XCode 4) или Windows (Microsoft Visual Studio 2008 и выше). У вас также есть возможность использовать Eclipse IDE на любой платформе.
В то время, когда вы писали, Juce подвергался серьезной переработке, и IntroJucer мог быть не таким стабильным, как того хотелось, особенно в системах, отличных от OS X или Windows. Вы должны посмотреть на это снова. IntroJucer не требуется для создания приложения Juce (хотя это может упростить задачу).
Я предлагаю вам сначала создать демонстрационное приложение Juce для вашей платформы. Если Ubuntu доставляет вам неприятности, попробуйте сначала OS X или Windows. После запуска демонстрации Juce вы можете перейти к IntroJucer. Если это работает, попробуйте скомпилировать Juce Demo для Android. На ваши вопросы можно ответить на форуме Android Juce:
http://rawmaterialsoftware.com/viewforum.php?f=13