Возможно, вам не нужно переходить. Вы можете просто проверить весь набор внешних источников, заменить на те, которые вам дали, и тогда, когда вы выполните регистрацию, TFS будет показывать только те файлы, изменения которых были обновлены в этом наборе изменений.
Перед выполнением регистрации вы можете сравнить каталог с внешними источниками в полностью изолированном каталоге, чтобы убедиться, что вы удалили все файлы, которые были удалены / переименованы во внешнем источнике. SourceGear's DiffMerge бесплатен и имеет хорошую функцию сравнения каталогов, которая поможет вам сделать это.