*.jar файлы - это просто множество *.class файлов, сжатых в один.Вроде как, если вы архивируете множество скомпилированных классов Java в файл *.zip.При использовании нескольких jar s не будет никаких дополнительных задержек, за исключением, может быть, дополнительного времени, необходимого для времени выполнения Java, чтобы найти, открыть и прочитать каждый отдельный файл jar.
Таким образом, использование нескольких jar-файлов или одного jar-файла не сильно повлияет на производительность среды выполнения, но может замедлить время запуска.Особенно для апплетов, где файлы должны быть загружены в первую очередь.