Вы можете использовать Powershell. Вот простой пример:
$ie = new-object -com "InternetExplorer.Application"
$ie.visible = $true
$ie.navigate2("www.myweb.com")
$doc = $ie.Document
$input1 = $doc.getElementById("username")
$input1.value = "user"
$input2 = $doc.getElementById("password")
$input2.value = "pwd"
$button = $doc.getElementById("submit")
$button.click()