Вы не хотите редактировать plugin-cfg.xml вручную (за исключением очень редких случаев). Имена хостов взяты из псевдонимов, определенных для виртуальных хостов WebSphere.
По умолчанию они обычно имеют *: 80, поэтому изменение имени домена сервера вообще не потребует изменений. Например:
<VirtualHostGroup Name="default_host">
<VirtualHost Name="*:9080"/>
<VirtualHost Name="*:80"/>
<VirtualHost Name="*:9443"/>
<VirtualHost Name="*:5060"/>
<VirtualHost Name="*:5061"/>
<VirtualHost Name="*:443"/>
</VirtualHostGroup>
Если виртуальный хост WebSphere, используемый вашим приложением, указывает псевдоним с определенным именем домена, вы просто меняете имя домена.