1) Добавьте свой ресурс в пакет в DeployTool в части общих ресурсов
2) Читать с помощью:
fullfile(ctfroot(),'config.txt');
Редактировать : Это подходит, если ваша конфигурация является "частной", то есть пользователь не должен редактировать ее. В этом случае он развертывается вместе с вашей программой в качестве ресурса. Если вам нужна «публичная» конфигурация для пользователей, я не знаю лучшего способа, чем сделать то, что вы предложили.