Для каждого документа Ext необходимо установить свойство config floating:true
и явно указать его положение после рендера, потому что он позиционируется абсолютно.
Пример:
var p = new Ext.form.FormPanel({
title:'test',
width: 300,
height: 150,
html:'a floating panel',
floating: true,
renderTo: Ext.getBody()
});
p.setPosition(200,200);