NotificationManager notificationManager=(NotificationManager)context.getSystemService(NOTIFICATION_SERVICE);
Это создает экземпляр класса messagesManager. Тогда у вас будет объект уведомления, с помощью которого вы сможете выполнить любую настройку. Чтобы установить количество полученных сообщений, просто установите это:
notification.setNumber(1);