Это само по себе не решение вашей проблемы, но оно позволит вам использовать ваши собственные подклассы UIView в других NIB.
Что я делаю, я просто перетаскиваю обычный экземпляр UIView на чертежную доску, а затем открываю панель «Утилиты» (панель, которая появляется в крайнем правом углу), а затем инспектора идентификации (третий значок рядом с) и в самом верху есть раздел с надписью «Custom Class». Я просто заменяю там атрибут «Class» на имя моего подкласса.