Я сталкивался с той же проблемой в Visual Studio 2015, я пытался открыть файл с
Right Click > Open With > ADO.NET Entity Data Model Designer
и опции там нет. Оттуда я понял, что моя установка Visual Studio 2015 должна быть без каких-либо компонентов, поэтому я вернулся к установке и установил Microsoft SQL Server Data Tools и Microsoft Web Developer Tools. Наконец-то это сработало! Варианты есть, когда вы открываете из решения, и файл может быть открыт
Компоненты, которые я добавил