Если вы действительно должны выжать максимальную производительность из этой вещи, и если память не имеет значения, вы можете попытаться сохранить каждый из ваших флагов в целом числе, размер бит которого равен ширине шина данных вашего процессора.
Возможно, вы используете 64-битный процессор шины данных, поэтому попробуйте длинные целые числа.