Выходной шейп-файл для сети igraph в R - PullRequest
Новая
       12

Выходной шейп-файл для сети igraph в R

7 голосов
/ 09 февраля 2012

Здравствуйте, у меня есть сеть в R, использующая библиотеку igraph 

Vertices: 616 
Edges: 6270 
Directed: TRUE 
No graph attributes.
Vertex attributes: name, Lat, Lon.
Edge attributes: V3.

Как я могу сгенерировать два шейп-файла для вершин и ребер, используя информацию о широте и долготе в вершине?

1 Ответ

9 голосов
/ 09 февраля 2012

Вы можете сделать это, используя пакеты sp и maptools. Есть удобные функции writePointsShape() и writeLinesShape() в maptools, которые будут записывать в формат шейп-файла ESRI.

Перед этим необходимо извлечь широту / долготу из вершин графа и поместить ее в SpatialPoints объект для вершин и SpatialLinesDataFrame объект для ребер.

Этот код создает очень простой объект igraph для следующего примера: 

library(igraph)

## Produce a ring graph with 4 vertices
x <- graph.ring(4)

## Add lat/lon information to vertices
V(x)$lat <- c(50, 50, 51, 51)
V(x)$lon <- c(40, 41, 41, 40)

Теперь создайте объект SpatialPoints для вершин 

library(sp)
library(maptools)

## Create SpatialPoints object containing coordinates
xV <- SpatialPoints(cbind(V(x)$lon, V(x)$lat))

## Write vertices to a shapefile
writePointsShape(xV, fn="vertices")

Наконец, создайте объект SpatialLinesDataFrame для краев. Это немного грязно, но мне еще предстоит найти быстрый способ создания объекта SpatialLines с заданными координатами. 

## Create SpatialLinesDataFrame object describing edges
edges <- get.edgelist(x)+1
edges <- cbind(edgeNum=1:nrow(edges), v1=edges[,1], v2=edges[,2])
xE <- apply(edges, 1, function(i) Lines(Line(cbind(c(V(x)$lon[i["v1"]], V(x)$lon[i["v2"]]), c(V(x)$lat[i["v1"]], V(x)$lat[i["v2"]]))), ID=as.character(i["edgeNum"])))
xE <- SpatialLinesDataFrame(SpatialLines(xE), data=data.frame(edgeNum=1:nrow(edges)))

## Write edges to a shapefile
writeLinesShape(xE, fn="edges")
...