Только что разобрался в приличном обходном пути. В зависимости от содержимого, с которым вы имеете дело, простое решение состоит в том, чтобы установить display: none для рассматриваемого тега, а затем просто добавить следующий код в js.
jQuery(document).ready(function($) {
$('a[rel*=facebox]').facebox({
loading_image : 'images/ajax-loading.gif',
close_image : 'images/fb_closelabel.png'
});
$('a[rel*=facebox]').show();
})
и в вашем html:
<a href="linktosomewhere.php" rel="facebox" style="display:none;">Click to goto somewhere</a>
Несколько месяцев спустя, но надеюсь, что это кому-нибудь поможет!