Я не уверен, поможет ли это, но немного личного опыта по этому вопросу:
Вы пытались зайти на iPad Setting - Safari - Блокировать всплывающие окна ? Попробуйте отключить блокировку всплывающих окон, это должно сработать.
Если он все еще не появляется, попробуйте включить консоль отладки для ipad и проверьте, не появляется ли какая-либо ошибка во время всплывающего события.
Попробуйте использовать URL для window.open, чтобы он был локальным / доменным URL-адресом домена. Я думаю, что это работает (без необходимости отключать блокировщик всплывающих окон в Safari Ipad).