Существует ограничение на размер документа. Это (по состоянию на v1.8) 16 МБ. Так что вы можете просто выйти из комнаты, если вы обновите и вставите. Кроме того, Mongo выделяет пространство для документов на основе среднего размера документа в коллекции. Если вы продолжите корректировать / изменять размер, это может иметь негативные последствия для производительности.
Я думаю, что гораздо безопаснее создавать новые документы для каждой записи, и если / когда вы хотите сопоставить эти данные, вы делаете это на карте / сокращаете работу.