ОК, решено.
Element elem = (Element) list.get(jTable.convertRowIndexToModel(jTable.getSelectedRow()));
где:
Element
- класс сущности
list
- entityManager.createQuery("SELECT e FROM Element e").getResultList();
Убедитесь, что список доступен для наблюдения (чтобы увидеть изменения в jTable сразу).