У вас есть пример такого рода общения?Любой простой пример, кроме документации (пример из реального мира) был бы хорош.
Взгляните на http://UndocumentedMatlab.com/blog/jmi-java-to-matlab-interface/ и его последующие статьи - они о Java, но интерфейс должен быть довольно похож на C #.