Можете ли вы клонировать репозиторий, используя родной git?Если вы можете сделать это, просто клонируйте его, используя собственный git, а затем импортируйте проект в Eclipse, используя:
File -> Import -> Projects from Git -> Local
Если ваше затмение работает в Windows, вам понадобится машина Linux (виртуальная машина подойдет) иклонировать репо в хранилище в формате NTFS или Fat32.После этого вы сможете скопировать клонированный репозиторий в вашу папку git на компьютере с Windows.