Для меня, используя пакет совместимости (преобразования) для Office 2003, просто меняя местами параметры в приведенном вами примере;например, если это также работает для ~ \ Office14 (что я предполагаю и надеюсь, что это работает), измените команду следующим образом:
"C:\Program Files\Microsoft Office\Office14\excelcnv" -nme -oice D:\test\old.xls D:\test\new.xlsx
В моем случае, конкретная команда, которая заставляет ее работать, я нашел вон там (и просто изменил параметры следующим образом), это:
"C:\Program Files (x86)\Microsoft Office\Office12\excelcnv.exe" -oice "C:\scripts\test1.xls" "C:\scripts\test1.xlsx"