Хорошо, учитывая, что это гипотетически, если EF не поддерживает это напрямую, просто заставьте это произойти в процессе:
employees = context.Employees
.AsEnumerable()
.Where(ee => ee.EmployeeID.ToString().Contains(text))
.ToList();
Учитывая, что это уже плохая идея, получение всех данных о сотрудниках не намного хуже;)