Это не будет работать, потому что тип базы данных является частью файла EDMX (сначала модель).Вам потребуются два разных файла EDMX с одинаковыми сущностями, но с разным определением хранилища (SSDL-часть файла EDMX).Вам также понадобится поставщик MySql на вашей машине для разработки (я не уверен, что это также требует самого MySql).И, наконец, вам понадобятся разные строки подключения с использованием метаданных из правильного файла EDMX.
Это довольно плохая идея, потому что вы все равно должны тестировать свое приложение на MySQL.Идея, что вы будете разрабатывать приложение на одном сервере баз данных, а оно будет работать только на другом, не совсем верна.