Эта ошибка
/home/user/navit-0.2.0/navit/gui/qml/.libs/libgui_qml.so:
undefined symbol: _ZN8NGQProxy16staticMetaObjectE
обычно означает, что версии библиотеки как-то не совпадают.Попробуйте скомпилировать и запустить Navit и все плагины в одной и той же системе и посмотрите, сохраняется ли проблема.
navit:main_real:Error parsing 'navit1.xml':
Element 'gui' within unexpected context 'gui'.
Expected 'navit' at line 46, char 164
Это похоже на ошибку в navit1.xml (хотя она может быть вызвана предыдущейошибка).Вы пытались исправить navit1.xml?В этом действительно есть ошибка?