Не знаю, содержит ли слой flash в стеке просмотра только скомпилированный файл swf flash
http://help.adobe.com/en_US/Flash/10.0_UsingFlash/WSFD77A256-0DE1-46c7-86FB-CC4A8AE2EAA6.html
В общем, очень легко работать с компонентами флеш-памяти или с любой пользовательской работой, которую вы разрабатываете во флеш-памяти, внутри flex. Вы можете общаться и контролировать подкомпоненты, как если бы вы были во флэш-памяти. Единственным исключением является загрузка фрагмента as2 в flex или as3, тогда вам нужно использовать localconnection для обработки связи между ними. Не уверен, если это именно то, что вы спрашиваете, поможет уточнить.