Самый простой способ - написать файл .bat, в котором будут указаны ваши данные для входа в систему, а затем текстовый файл с вашими командами. Затем вы можете запустить этот файл .bat, который откроет замазку и выполнит все команды, которые есть в списке.
Но после всего этого мое требование изменилось на наличие независимого графического интерфейса для управления моим сервером, поэтому я согласился бы с Равном Андерсоном, но это потребовало бы больших усилий.
Так что все зависит от того, какое приложение вам нужно.