Местоположение, которое я нашел в MacOS Mojave с jre 1.8.0:
/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/security
Я не пытался делать какие-либо вещи в хранилище сертификатов Java, но мне нужно было настроить некоторые параметры безопасности для апплета,
Кроме того, можете ли вы поверить, что это 2019 год, и мы все еще бездельничаем с этим дерьмом?;)