Я решил эту проблему, написав хук post-commit, который chmods все файлы в каталоге. Это не совсем то, к чему я стремился, потому что он беспорядочно изменяет все файлы в каталоге, а не только те, которые я изменил в локальном коммите, но он работает достаточно хорошо.