Попробуйте, сложно дать однозначный ответ, так как я не уверен, какие символы могут появиться в URL, который нужно проанализировать, но это будет работать с опубликованным вами URL -
var url = "www.mysite.com/?url=www.google.com?client=xxxxxx"
url = url.split('?url=')[1].split(/\?|\%3F/)[0];
if (url.indexOf('http://') == -1) url = 'http://' + url;
$("a#download").attr("href",url);
Демо - http://jsfiddle.net/J77J2/