Существует потеря незначительного в "ссылочном соке" через 301. Поэтому, если на сайте A есть следующие страницы (со всеми ссылками на него):
www.example1.com/
И на сайте B есть эти страницы со ссылками на следующий
www.example2.com/
www.example2.com/?linkid=101 (301ed to www.example2.com/)
www.example2.com/?linkid=102 (301ed to www.example2.com/)
www.example2.com/?linkid=103 (301ed to www.example2.com/)
Тогда сайт А будет ранжироваться немного лучше, чем сайт Б, при прочих равных условиях.
Возможно, вы захотите использовать на своих страницах новый элемент Canonical Link Element вместо 301. Вот видео от Мэтта Каттса из Google, объясняющее почему:
http://www.youtube.com/watch?v=Cm9onOGTgeM&feature=channel_page