Bugzilla - это инструмент отслеживания инцидентов, который помогает аналитикам, разработчикам и QA управлять инцидентами для программного продукта. Я не думаю, что это то, что вы ищете.
Когда вы говорите, что ошибки трудно отлаживать в NetBeans, вы имеете в виду, что подобные ошибки проще в другой IDE, такой как Eclipse?
Если нет, я думаю, что вместо того, чтобы искать инструмент, который покажет вам точную линию ошибок, вам нужно больше понять, как генерируются и сообщаются ошибки разработки Java. Некоторые поиски такого типа понимания должны дать немало результатов.