Страница about: flags или лучше chrome: // flags должна работать.
Найдите enable-nacl и нажмите на ссылку включения. Перейдите в конец этой страницы и не забудьте нажать на перезапуск.сейчас
Но не активируйте enable-nacl-debug, пока не узнаете, как запустить отладчик.В этом случае ваш модуль nacl будет ждать отладчик вечно.