Решение состоит в том, чтобы перейти в меню «Инструменты» и выбрать «Преобразовать исходные пути». Появится диалоговое окно, которое позволит вам преобразовать пути в относительные и указать, что вновь добавленные файлы всегда используют относительные пути. «Изменить все пути на относительные» у меня не сработало, но изменение только путей к папкам как минимум заняло меньше времени, чем редактирование деталей каждого файла.