Задача DNS - преобразовывать полные доменные имена в IP-адреса.В IIS вы указываете, какой IP-адрес использовать, из пула IP-адресов, назначенных вашему веб-серверу, с каким сайтом из множества размещенных на вашем веб-сервере.
Проверьте, правильные ли у вас записи записей канонического имени (CNAME)вы AD для нужных IP-адресов.
Также убедитесь, что он реплицируется на все DNS-серверы, если у вас есть балансировка нагрузки в AD.