Если вы хотите нарисовать что-то прямо на поверхности другого объекта (используя точно такие же координаты вершины), вам нужно будет использовать glPolygonOffset
для предотвращения сшивания. В Красной книге есть глава, которая объясняет это.
Если внутри вы хотите нарисовать что-то в объеме куба, то ничто вас не остановит. Вам просто нужно получить альфа-значения и правильное смешивание, чтобы реально видеть сквозь куб. Ищите несколько общих руководств по прозрачности в OpenGL.
Но, может быть, я ужасно ошибаюсь и в том, что вы ищете текстуры.
Если я вас правильно понимаю, вы можете просто сгенерировать соответствующую текстуру с точками и применить ее к кубу.