Настройщики диаграмм, безусловно, дают вам полный контроль над тем, что вам нравится. Но, возможно, в этом случае вы могли бы сделать некоторые интересные вещи без настройщика диаграмм.
Я не уверен, что вы имеете в виду под "масштабированием должным образом", поэтому я не могу комментировать эту часть.
Вы можете добавить группу в отчет, чтобы на диаграмме не было слишком много значений. Например, вы можете сгруппировать по выражению наподобие этого:
new Integer($V{REPORT_COUNT}/10)
Таким образом, вы получите только 10 предметов в каждой группе. Поместите диаграмму в нижний колонтитул группы. В случае, если у вас меньше 10 строк, вы получите один график. Если у вас есть больше строк, вы получите несколько графиков.
Ваша группировка, вероятно, будет более сложной, чем просто подсчет строк, но должна применяться та же идея.