Я знаю, что это старенький, но я только что понял этот фрагмент, который работает как брелок в моей настройке i3wm, поэтому я мог бы поделиться им со всеми.
(add-hook 'focus-in-hook
(lambda () (progn
(setq org-tags-column (- 5 (window-body-width)))) (org-align-all-tags)))
(add-hook 'focus-out-hook
(lambda () (progn
(setq org-tags-column (- 5 (window-body-width)))) (org-align-all-tags)))