Не могли бы вы решить эту проблему, сгенерировав уникальный идентификатор перед вставкой новой строки, а затем добавив этот идентификатор в каждую запись? Это позволит вам идентифицировать обе записи после их создания.
Я бы также спросил, зачем вам эта функциональность. Вы добавляете записи в две разные таблицы, когда файл копируется в папку. Очевидно, я понятия не имею, каково решение, поэтому я не могу советовать так или иначе.
Тем не менее, я бы посоветовал еще раз включить логику организации данных FileMaker в процесс ODBC. Похоже, оригинальная запись должна действовать как маркер или триггер. Можно ли оставить процесс ODBC просто механизмом создания записи, а логику использования этой записи можно оставить другому процессу, скажем, сценарию FM?