Я считаю, что проблема в том, что вы не можете ограничить возможности устройства после отправки.Из часто задаваемых вопросов по управлению приложениями в iTunes Connect:
"Чтобы изменить информацию о требованиях к устройству после отправки первого двоичного файла, необходимо отправить обновление приложения в iTunes Connect, чтобы предоставить новый двоичный файл с новой информацией в ключе UIRequiredDeviceCapabilities. Вам разрешено расширять только требования к своему устройству. Запрещено отправлять обновление в свой двоичный файл, чтобы ограничить требования к устройству."[выделение добавлено]
Я искалспособ обойти это, или Apple специально разрешить удаление поддержки armv6 с подходом релиза iOS5.Скрещивание пальцев.: - /