«Один README» - только пример. Конечно, вы можете добавлять, фиксировать и отправлять столько файлов, сколько захотите. README-файл является особенным для github, потому что он показан внизу страницы репозиториев (примечание: работает и в подкаталогах). Это единственная причина, почему они упоминают только эту.
git add README
git add otherFile
git add aDirectory
Это действительно не имеет никакого значения для github , когда вы фиксируете и загружаете определенные файлы в github. Тем не менее, я привык добавлять только самые общие файлы (README и некоторые файлы лицензий) к первоначальной фиксации. Это просто вопрос ваших личных предпочтений.