У меня сложилось впечатление, что whirr не всегда запускает все службы надежно.Звучит так, как будто начался namenode (namenode отвечает за хранение информации каталога), но датодет не запустился (datanode хранит данные).
Попробуйте запустить
hadoop dfsadmin -report
, чтобы увидеть,доступна дата данных.
Если нет: часто это помогает перезапустить кластер.