Вы не можете напрямую вызывать код JavaScript из кода C #. Последний выполняется на сервере в ответ на запрос, а первый выполняется на клиенте после того, как сервер завершил обработку и доставил ответ.
Что вы можете сделать, как показал @Darin Dimitrov в своем примере, - это определить, когда в коде C # доставлять эту функцию JavaScript клиенту, и указать, когда ее выполнять. Обычно это происходит, когда страница отображается, возможно, с небольшой задержкой, в ответ на какое-либо событие страницы (например, нажатие кнопки).
Естественно, это означает, что это должно происходить посредством обратной передачи при ответе на событие страницы, что может не соответствовать потребностям пользователя. Можете ли вы подробнее рассказать, когда нужно вызывать этот метод? Имейте в виду, что взаимодействие со страницей и взаимодействие с сервером - это две разные вещи. Весь код C # выполняется до того, как код JavaScript станет доступен. Скорее всего, , что вы хотите сделать в ответ на событие страницы и должны быть выполнены полностью на JavaScript на стороне клиента, а не из C #.