Вы должны сделать два шага:
1) Определите контексты метода в задаче , содержащей регулярные выражения для методов, которые вы хотите сопоставить, например:
<clover-setup ...>
<methodContext name="equals" regexp="public boolean equals\(.*\)"/>
<methodContext name="hashCode" regexp="public int hashCode\(\)"/>
</clover-setup>
2) Определите, какие контексты методов должны быть исключены из отчета в задаче
<clover-report>
<current outfile="clover_html" title="My Coverage">
<format type="html" filter="equals,hashCode"/>
</current>
Дополнительная информация: