В проекте eclipse была когда-то переменная classpath JAVA_TOOLS (указывающая куда-то на установку Java). Переменная больше мне не нужна, поэтому я удалил ее из проекта, но затмение все еще жалуется
Unbound classpath variable: 'JAVA_TOOLS' in project '...'
и отказывается что-либо делать. Я также удалил переменную из eclipse и очистил проект. Команда find . -type f | xargs grep JAVA_TOOLS
не возвращает совпадений, поэтому я понятия не имею, где ссылка еще может существовать.