Здесь есть несколько подходов.
1- Запишите процесс синхронизации, чтобы каждый раз перестраивать серверные таблицы (на клиенте) с помощью SELECT INTO. После завершения переименуйте текущую таблицу в временную таблицу и переименуйте вновь созданную таблицу с правильным именем. Процесс синхронизации должен УДАЛИТЬ временную таблицу как один из ее первых шагов. Наконец, воссоздайте индексы, и вы должны быть в курсе.
2 - Создайте резервную копию базы данных на стороне сервера, напишите сценарий оболочки, чтобы скопировать его и восстановить на клиенте.
Каждая из этих опций сохранит ваши порядковые номера. Какой из них вы выберете, зависит от ваших навыков. Если вы больше являетесь разработчиком, вы можете сделать работу № 1. Если у вас есть навыки работы с Oracle DBA, вы сможете заставить # 2 работать.
Так как вы на 11g, возможно, есть более чистый способ сделать это с помощью Data Pump.