Это зависит от того, хотите ли вы в будущем обновить Subversion, используя инструменты управления пакетами Debian. Сборка из исходного кода должна быть достаточно простой и позволяет настраивать ее так, как вы хотите, но затем каждый раз, когда вы захотите обновить ее, вам нужно будет снова собрать ее из исходного кода, а не просто apt-get.